2007年起，国际航行船舶电子管理系统在南通口岸正式全面推广。该系统的全面实施使国际航行船舶进出境的报检、查验、放行等一系列环节将全面实现电子化。此举可极大限度地节约了出入境船舶的滞港时间。

　　据南通检验检疫部门介绍，国际船舶电子管理系统是由江苏检验检疫局耗时三年研发成功的。该系统涵盖了船舶进出口岸检疫查验、监督的各个环节，船舶代理人员足不出户便可以完成进出境船舶的报检，检疫机关核准并查验合格后即可通过该电子管理系统予以放行，在严格把关的同时，加快了通关速度。据悉，该系统已受到国家质检总局的肯定并将在全国范围内推广。